RNA-Sick@Day5 > 原來是純文字編輯器啊，我還以為是整合式開發環境呢｜準備一個喜歡的打字所在 feat. Atom
原文發表於第 11 屆 iT 邦幫忙鐵人賽 (https://ithelp.ithome.com.tw/articles/10217983) 英雄需要披風，搞資訊的人需要一個自己喜歡的純文字編輯環境 有一幕令我印象十分深刻，非常用功的專題生把該搜集的序...
RNA-Sick@Day4 > 我們凡事求一個圓｜第一次執行 Python 腳本就來算圓周率吧 feat. Jupyter Notebook
原文發表於第 11 屆 iT 邦幫忙鐵人賽 (https://ithelp.ithome.com.tw/articles/10217180) 在夏末的傍晚，突然想用電腦算個圓周率 說算就算，原理什麼的先不管～我們在上一篇中已經安裝好 Anaconda 了，好想趕快寫點 python...
RNA-Sick@Day3 > 小孩子才要做選擇，我全都要｜入門生物資訊該學什麼語言呢 feat. Anaconda
原文發表於第 11 屆 iT 邦幫忙鐵人賽 (https://ithelp.ithome.com.tw/articles/10217036) 勇者您好，請選擇初始職業與裝備 這篇繼續進行啟程前的準備，雖然我在引言中強調過不見得要寫程式，只要執行現成的程...
RNA-Sick@Day2 > 一旦接受了這種設定，操作起電腦還是挺帶感的嘛｜像個駭客一樣用電腦 feat. Terminal (終端機)
原文發表於第 11 屆 iT 邦幫忙鐵人賽 (https://ithelp.ithome.com.tw/articles/10216613) 喜歡打字嗎？那你先不要用滑鼠 有一個關於生物資訊的謠言，就是一定要在 Unix-like 作業系統上面分析，而且要用純文字的方式輸...
RNA-Sick@Day1 > 你己被選中成為「賽博格研究生」｜生物資訊 の 冒險記趣 feat. Phylo
原文發表於第 11 屆 iT 邦幫忙鐵人賽 (https://ithelp.ithome.com.tw/articles/10215861) 想寫點生物資訊的東西，為什麼要扯賽博格 生物資訊 (bioinformatics) 是利用應用數學、資訊學、統計學和電腦科學的方法研究生物問題的...
[ 留學 ] 107年公費留考 ✍️
中華民國教育部公費留考 - 考試經驗分享 學群與科目：農林漁牧類農作物安全管理之採收後處理 報考機緣與考前狀況 大概是年初開始有出國讀書的打算，也就是...
[ 留學 ] 托福兩週衝刺一戰破百 - 字神
申請字神 TOEFL 托福獎學金的備考心得，其實我花了 27k 報了全科班之後上不到一半的課，只有口說有全部上完，在這邊把一些還記得的備考心態紀錄一下，提供給本...
uniref30 [46G] wget -bqc http://wwwuser.gwdg.de/~compbiol/uniclust/2020_06/UniRef30_2020_06_hhsuite.tar.gz BFD [272G] wget -bqc https://bfd.mmseqs.com/bfd_metaclust_clu_complete_id30_c90_final_seq.sorted_opt.tar.gz structure templates (including *_a3m.ffdata, *_a3m.ffindex) [over 100G] wget -bqc https://files.ipd.uw.edu/pub/RoseTTAFold/pdb100_2021Mar03.tar.gz for CASP14 benchmarks, we used this one: https://files.ipd.uw.edu/pub/RoseTTAFold/pdb100_2020Mar11.tar.gz tar xfz weights.tar.gz mkdir -p bfd tar xfz bfd_metaclust_clu_complete_id30_c90_final_seq.sorted_opt.tar.gz -C ./bfd tar xfz pdb100_2021Mar03.tar.gz mkdir -p UniRef30_2020_06 tar xfz UniRef30_2020_06_hhsuite.tar.gz -C ./UniRef30_2020_06 resources Cores: 1 CPU Utilized: 01:15:07 CPU Efficiency: 45.94% of 02:43:30 core-walltime Memory Utilized: 39.91 GB Memory Efficiency: 99.77% of 40....