RNA-Sick@Day3 > 小孩子才要做選擇,我全都要|入門生物資訊該學什麼語言呢 feat. Anaconda

原文發表於第 11 屆 iT 邦幫忙鐵人賽 (https://ithelp.ithome.com.tw/articles/10217036) 勇者您好,請選擇初始職業與裝備 這篇繼續進行啟程前的準備,雖然我在引言中強調過不見得要寫程式,只要執行現成的程...

September 18, 2019 · 4 min · Chen Hsieh

RNA-Sick@Day2 > 一旦接受了這種設定,操作起電腦還是挺帶感的嘛|像個駭客一樣用電腦 feat. Terminal (終端機)

原文發表於第 11 屆 iT 邦幫忙鐵人賽 (https://ithelp.ithome.com.tw/articles/10216613) 喜歡打字嗎?那你先不要用滑鼠 有一個關於生物資訊的謠言,就是一定要在 Unix-like 作業系統上面分析,而且要用純文字的方式輸...

September 17, 2019 · 4 min · Chen Hsieh

RNA-Sick@Day1 > 你己被選中成為「賽博格研究生」|生物資訊 の 冒險記趣 feat. Phylo

原文發表於第 11 屆 iT 邦幫忙鐵人賽 (https://ithelp.ithome.com.tw/articles/10215861) 想寫點生物資訊的東西,為什麼要扯賽博格 生物資訊 (bioinformatics) 是利用應用數學、資訊學、統計學和電腦科學的方法研究生物問題的...

September 16, 2019 · 5 min · Chen Hsieh

[ 留學 ] 107年公費留考 ✍️

中華民國教育部公費留考 - 考試經驗分享 學群與科目:農林漁牧類農作物安全管理之採收後處理 報考機緣與考前狀況 大概是年初開始有出國讀書的打算,也就是...

January 18, 2019 · 13 min · Chen Hsieh

[ 留學 ] 托福兩週衝刺一戰破百 - 字神

申請字神 TOEFL 托福獎學金的備考心得,其實我花了 27k 報了全科班之後上不到一半的課,只有口說有全部上完,在這邊把一些還記得的備考心態紀錄一下,提供給本...

October 14, 2018 · 3 min · Chen Hsieh

uniref30 [46G] wget -bqc http://wwwuser.gwdg.de/~compbiol/uniclust/2020_06/UniRef30_2020_06_hhsuite.tar.gz BFD [272G] wget -bqc https://bfd.mmseqs.com/bfd_metaclust_clu_complete_id30_c90_final_seq.sorted_opt.tar.gz structure templates (including *_a3m.ffdata, *_a3m.ffindex) [over 100G] wget -bqc https://files.ipd.uw.edu/pub/RoseTTAFold/pdb100_2021Mar03.tar.gz for CASP14 benchmarks, we used this one: https://files.ipd.uw.edu/pub/RoseTTAFold/pdb100_2020Mar11.tar.gz tar xfz weights.tar.gz mkdir -p bfd tar xfz bfd_metaclust_clu_complete_id30_c90_final_seq.sorted_opt.tar.gz -C ./bfd tar xfz pdb100_2021Mar03.tar.gz mkdir -p UniRef30_2020_06 tar xfz UniRef30_2020_06_hhsuite.tar.gz -C ./UniRef30_2020_06 resources Cores: 1 CPU Utilized: 01:15:07 CPU Efficiency: 45.94% of 02:43:30 core-walltime Memory Utilized: 39.91 GB Memory Efficiency: 99.77% of 40....

1 min · Chen Hsieh